PDI- Dpto de Física Nº 48
PI Nº 48. “Dinámica molecular de colorantes de interés biofísico”
Director: CAMPO, Mario
Integrantes: CORRAL, Griselda
Periodo de realización del proyecto:01/01/2014 al 31/12/2016
Contacto: mario@exactas.unlpam.edu.ar
Resumen:
El proyecto se enmarca en el grupo de investigaciones que intentan producir avances en el conocimiento de la estructura y el comportamiento de drogas anticáncer, antivirales y antibióticas que interactúan con el ADN. La proflavina y otros colorantes resultan de particular interés, dado algunos trabajos previos que ha realizado este grupo de investigación. De acuerdo a los antecedentes, la interacción de la proflavina y otros colorantes con el adn está influenciada por la interacción de estas moléculas con el solvente y otras sustancias presentes en la solución. Aún no se han estudiado suficientemente la estructura de hidratación de los colorantes (ver sección 5.1), lo que permitiría analizar la interacción de estas moléculas con el agua como solvente, y así inferir algunas características de su comportamiento al acercarse al entorno de la doble hélice de ADN. En este proyecto se propone entonces analizar del comportamiento y las características de hidratación de colorantes en solución (con o sin presencia de otros solutos) utilizando técnicas de dinámica molecular. De esta manera se podrá estudiar como resulta la etapa previa a la intercalación y/o fijación de los colorantes en el ADN.
Palabras claves: dinámica molecular, ADN, colorantes, bret, proflavina.
Abstract:
The project is part of a group of researches attempting to produce advances in the understanding of the structure and behavior of anticancer drugs, antiviral and antibiotic that interact with DNA. According to some previous studies conducted by this research group, proflavine and other dyes are of particular interest. According to the bibliography, the interaction between proflavine and other dyes with DNA is influenced by the interaction of these molecules with the solvent and other substances present in the solution. The hydration structure of the dyes has not yet been studied reliably. This study would analyze the interaction of these molecules with water as the solvent, and then infer some characteristics of their behavior when approaching the vicinity of the double helix DNA. This project aims to analyze then the behavior and hydration characteristics of dyes in solution (with or without other solutes) using molecular dynamics. Then we can study how is the previous stage to the interleaving and/or fixation of the dyes in DNA.
Keywords: molecular dymanics, DNA, dyes, bret, proflavine.